Os bebedouros normalmente são vistos como equipamentos que exigem poucos cuidados além de conferir se o nível de água está baixo. Mas, na verdade, se sujo, o bebedouro pode entupir e até ser catalizador de contaminações, através da formação natural de biofilmes e algas, que se reproduzem quando expostos à luz e se proliferam no equipamento.

   A presença destes organismos pode alterar o cheiro e o gosto da água. Para evitar essas situações, é necessário fazer a higienização do bebedouro periodicamente. Uma vez por mês é recomendação da maioria dos fabricantes e da Organização Mundial da Saúde. Mas se for conveniente, essa limpeza pode e deve ser adiantada.